集体获奖

中国科学院获中央国家机关平安奥运行动地下空间安全管理先进单位

中国科学院获中央国家机关人防工作目标管理与责任制考核先进单位

中国科学院获中央国家机关地下空间落实“平安奥运行动”工作先进单位

中国科学院获中央国家机关人防工作目标管理和责任制评议考核先进单位

中国科学院获首都全民义务植树先进单位

中国科学院获中央国家机关人口和计划生育工作先进集体

院工会获中央国家机关工会联合会综合工作奖

院工会获全国经审工作先进集体

京区党委获中央国家机关党内统计优秀报表单位

院侨联中国侨联“惠侨工程支持奖”

北京分院获2007年度中国科学院院地合作奖，先进分院二等奖

院地合作处获第十二届北京技术市场金桥奖（集体一等奖）

北京国家技术转移中心获中国技术市场金桥奖

北京国家技术转移中心获国家技术转移示范机构

北京国家技术转移中心获北京技术市场协会技术转移服务成效显著单位

个人获奖

何岩获中央国家机关工会联合会优秀工会主席

项国英获中央机关“创建文明机关争做人民满意公务员”活动先进个人

欧龙新、王敬泽、李凤霞获2008年度首都绿化美化积极分子

李静获第十二届北京技术市场金桥奖（个人一等奖）

周亚东获中央国家机关工委平安奥运先进个人

论文获奖 

《北京分院纪检监察管理工作机制研究》获中央国家机关党建研究成果二等奖（纪检监察审计处 组织人事处）

《解放思想改革创新争当新时期科技发展的火车头》被评为纪念党的十一届三中全会召开30周年理论研讨会入选论文，获得中宣部颁发的证书

（宣传教育处）

《中国科学院女博士心理压力调研报告》获得团中央“全团调研信息奖”三等奖（党群工作处）