2006年9月中科院与北京市签署新一轮合作协议，2009年12月院市双方签署“联合推动中关村国家自主创新示范区建设协议”。双方有关部门密切合作、互相支持，在科技奥运项目实施、重大科技成果在京转化和高新技术产业化等方面取得了实质性进展。