标识以动物所英文缩写“IOZ”的变形为主体，也突出了“动”字的变形，上方圆点与下侧半开O型图案表现了天地之合，中央Z型图案意喻生命科学漫长探索之路，延升之剑尾寓意科学高峰永无止境；整体色彩以蓝色为主，显现海之博大、天之浩瀚，天地间动物所似雄鹰展翅搏击长空、如巨龙盘踞蓄势待发；红色闪光圆点表达动物所的活力和热情；整体设计体现动物所探索、追求、发展、超越的完整理念。